生物育种:一个跨国种企大佬的六个关键洞见
我们为事件筛选团队(Event Selection Team)中的“原创家族”之一举办了退休晚宴,我有幸领导了这个团队。通过这次晚宴,我总结了六个经验教训,希望它们能对将来的生物技术创业者有所帮助。
1)载体构建是关键。将载体构建视为新想法,将事件视为该想法主题的不同变体。调整一个糟糕的想法得到的依然是一个糟糕的想法,将表现不佳的载体插入基因组的不同位置将带来令人失望的结果。
2)事件是性状开发的致命诱惑。被诱惑去在你最喜欢的载体构建中寻找那根针,是一条通向灾难的确定道路。
3)田间试验的目的是快速识别并舍弃非商业化的载体。在数据质量上投入资源和精心规划。任何显示出显著基因型与环境互作(GE)的载体都必须被舍弃,连同该载体中的所有事件。为你的新载体节省资源。
4)所有转基因和基因编辑事件都应具有定性的、单基因显性表型。如果它们没有,就应该舍弃该事件,因为市场期望该性状的效果始终存在。
5)几乎所有作物植物的基因组都包含重复序列,任何关于单一插入的假设都必须经过严格的挑战。要么是你来做,要么是你的监管团队来做,两者都应该淘汰多插入事件。
6)对你发布的第一个品种要有耐心。没有什么比遗传基因的性能更能扼杀性状的推出,客户不再接受新性状的平庸表现。性状并没有增加产量或作物价值,它只是保护了育种者所取得的遗传增益。Enogen玉米是这一规则的唯一例外。
我们评估了数千个事件,并商业化了比大多数公司更多的田间性状。当在自然界中已知某个目标蛋白时,性状研究科学家的工作通常是创造性的,并且通常是成功的。根据我的经验,我会这样发展一个性状管道:
- 为每个功能基因生成15-20个载体。深思熟虑地修改启动子、终止子序列、调控序列,并记得利用可能将你的蛋白隔离在有用位置的信号序列。
- 尽可能转育到最好的骨干亲本。
- 每个载体在温室中生成不超过100株T1>T2代表事件。强烈选择性状表达和种子生产能力。
- 每个载体田间测试不超过25个事件。如果你在那个队列中没有一个商业质量的事件,你很可能不会为那个载体生成一个。
- 不要计划回到转化实验室去生成更多中等成功的载体的事件。你没有时间,而且提高性能的可能性很低。
- 雇佣一个一流的统计学家,该统计学家向性状开发负责人报告,而不是向科学家或商业部门报告。这个角色相当于审计员,必须独立于那些对项目管道成功有既得利益的人。保持数据分析的简单性。载体队列不佳的第一个迹象是进行了无关统计精度的复杂数据分析。
- 警惕由高重复次数引起的统计学显著结果。农场规模的田间变异需要至少20蒲式耳的玉米和5蒲式耳的大豆才能在您的压力条件下看到。
- 在剔除载体和事件时要无情但不要残忍。对那些努力将它们带到田间的人表示同情。
我总是抵制那些认为性状带来市场价值的人,这种观念伤害了这个行业。转基因输入性状所能做的唯一事情就是保护育种者所取得的成就。任何基因编辑技术所能做的唯一事情就是创造可以被育种者利用以改善遗传基础的变异性。唯一的例外是黄金大米和Enogen 玉米,它们不是输入性状。教训是充分资助你的育种小组,并集中精力在你销售团队有关键质量以获胜的地方。
最后,一个性状应该只在一种作物中部署。耐草甘膦的大豆很好。耐草甘膦的玉米和棉花是走得太远的一步,我们正在为此付出代价。贪婪带来了杂草和昆虫的抗性。不仅仅是公司的贪婪(尽管这可能起了作用),而是将效率应用于整个作物轮作时的贪婪。保持对自然的警惕,以监测下一个压力因素将是什么,如果你对压力因素的解决方案是保持其有效性。
对这些想法的价值自行判断,但忽视它们是你自己的危险。最终,是育种者不显眼、逐步的遗传改进将养活世界。所有输入性状所能做的只是保护他们所取得的成就,或者在基因编辑的情况下,给他们一个以前不存在的变异来源。